Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2019 - 2024
1.607
P-Index
This Author published in this journals
All Journal HAYATI Journal of Biosciences Jurnal Agronomi Indonesia (Indonesian Journal of Agronomy) Agrohorti Bulletin (e-Journal) Jurnal Hortikultura Indonesia Buletin Hama dan Penyakit Tumbuhan Zuriat MIMBAR (Jurnal Sosial dan Pembangunan) Jurnal Natur Indonesia Microbiology Indonesia Biota: Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Indonesian Journal of Agricultural Science Jurnal AgroBiogen Jurnal Pengkajian dan Pengembangan Teknologi Pertanian Jurnal Penelitian Tanaman Industri Jurnal Tanaman Industri dan Penyegar Wacana, Jurnal Sosial dan Humaniora Jurnal RISET Geologi dan Pertambangan AGRIVITA, Journal of Agricultural Science Jurnal NERS Jurnal Agroekoteknologi International Journal of Sustainable Tropical Agricultural Sciences Indonesian Journal of Biotechnology UNEJ e-Proceeding Jurnal Penelitian Karet JURNAL HAMA DAN PENYAKIT TUMBUHAN TROPIKA Jurnal Bioteknologi & Biosains Indonesia (JBBI) ANNALES BOGORIENSES Constitutional Review ICoTE Proceedings Majalah Ilmiah Biologi BIOSFERA: A Scientific Journal Jurnal Penelitian Kelapa Sawit Journal of Tropical Crop Science Menara Perkebunan Berkala Penelitian Agronomi Journal of English Language Teaching Innovations and Materials (Jeltim) JIIP (Jurnal Ilmiah Ilmu Pendidikan) Jurnal Tanah dan Iklim Jurnal Agrotropika Budapest International Research and Critics Institute-Journal (BIRCI-Journal): Humanities and Social Sciences Jurnal Ilmiah Ibnu Sina (JIIS): Ilmu Farmasi dan Kesehatan Jurnal Pengabdian Ilung (Inovasi Lahan Basah Unggul) Journal of General-Procedural Dermatology & Venereology Indonesia Jurnal Edukasi Biologi
Sudarsono
Departemen Agronomi Dan Hortikultura Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor
Religion Agriculture, Biological Sciences & Forestry Arts Humanities Astronomy Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Chemistry Civil Engineering, Building, Construction & Architecture Computer Science & IT Dentistry Earth & Planetary Sciences Economics, Econometrics & Finance Education Energy Engineering Environmental Science Immunology & microbiology Industrial & Manufacturing Engineering Languange, Linguistic, Communication & Media Law, Crime, Criminology & Criminal Justice Materials Science & Nanotechnology Mathematics Medicine & Pharmacology Nursing Physics Public Health Social Sciences Other

Published : 83 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search
Journal : Jurnal Hortikultura Indonesia

 1 
Aplikasi Teknik Polymerase Chain Reaction (PCR) Menggunakan Primer Degenerate dan Spesifik Gen AV1 Untuk Mendeteksi Begomovirus Pada Tomat (Lycopersicon esculentum Mill.) Tri J. Santoso; Sri H. Hidayat; M. Herman; , Sudarsono
Jurnal Hortikultura Indonesia Vol. 4 No. 3 (2013): Jurnal Hortikultura Indonesia
Publisher : Indonesian Society for Horticulture / Department of Agronomy and Horticulture

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (492.334 KB) | DOI: 10.29244/jhi.4.3.140-149

Abstract

ABSTRACTBegomoviruses infection has been reported and found in several important vegetable crops included  tomato.  Nevertheless,  the  information  of  detection and  identification  of  Begomovirus infecting  tomato  plants  in  some  of tomato  production  areas  using  PCR  technique  has  not  been widely reported.  The  objective  of  this  research  was  to  detect  Begomovirus infecting  tomatoes  in some of tomato production areas of East Java, Central Java, Special Province of Jogjakarta and West  Java  using  PCR  technique with degenerate  and  specific  primers.  PCR  amplification  of Begomovirus genome was conducted by using a pair of degenerate primers, i.e. PAL1v1978-F and PAR1c715-R  and  specific  primer,  AV1-F/R.  For  confirmation  the  virus, it  was  conducted  a  virus transmission from the symptomed plant tomato sampel to healthy plants by using whiteflies vector. The  results  of  this research  showed  that  the  symptomed  plants  collected  from  several tomato production  areas  of  East  Java,  Central  Java,  Special  Province  of Jogjakarta  and  West  Java indicated that those plants have been infected by Begomovirus following PCR detection using a pair of degenerate primers. The Begomovirus infection was indicated by the PCR amplified product with the size of 1500 bp.  The results of PCR amplification  using specific primers AV1-F/R to detect the genus  of  Begomovirus  showed  that  all  samples  of  plant collections  generated  of  780  bp  DNA fragment. Confirmation of the virus through transmission by  whitefiles  vectors in greenhouse from the symptomed plants and the positive PCR samples showed that the virus transmission process was succesfully conducted with indication of the emergence of symptoms in healthy plants.Keywords: tomato  ( Lycopersicon  esculentum  Mill.) ,  Begomovirus, PCR technique, degenerate primerABSTRAKHasil  penelitian  sebelumnya  menunjukkan  bahwa  Infeksi  virus begomovirus di  beberapa tanaman sayuran termasuk tanaman tomat. Namun demikian, penelitian yang memberikan informasi mengenai  deteksi  dan  infeksi  dari virus  begomovirus  yang  menginfeksi  tanaman  tomat  dengan menggunakan teknik  PCR  masih  perlu  diteliti  lebih  lanjut.  Tujuan  dari  penelitian  adalah untuk mendeteksi begomovirus yang menginfeksi  tanaman  tomat di beberapa daerah produksi tomat dari Jawa Timur, Jawa Tengah,  Yogyakarta,  dan Jawa Barat menggunakan teknik PCR dengan primer degenerate  dan  spesifik. Amplifikasi  PCR  genom  begomovirus  dilakukan  dengan menggunakan sepasang  degenerate  primer  yaitu  PAL1v1978-F  dan   PAR1c715-R,  serta  primer  spesifik  adalah AV1-F/R.   Konfirmasi  virus dilakukan  dengan  teknik  penularan  virus  oleh  vektor  kutu  kebul ke tanaman sehat. Hasil penelitian menunjukkan bahwa  sampel-sampel tanaman tomat bergejala yang dikoleksi  dari  beberapa  daerah  di  Jawa Timur,  Jawa  Tengah,  Jawa  Barat  dan  D. I . Jogjakarta mengindikasikan adanya infeksi oleh Begomovirus setelah dideteksi menggunakan teknik PCR dengan primer degenerate.  Hasil amplifikasi PCR menggunakan primer spesifik AV1-F/R untuk mendeteksi  genus Begomovirus  menunjukkan  bahwa  semua sampel  tanaman  koleksi  menghasilkan  amplikon  yang berukuran  780  bp. Konfirmasi  virus  melalui  penularan  dengan  vektor  kutu  kebul  di  rumah kaca  dari sampel  tanaman  sakit  dan  positif  PCR  menunjukkan  terjadinya proses  penularan  virus  yang  ditandaidengan munculnya gejala-gejala pada tanaman yang sehat.Kata kunci: Begomovirus, Lycopersicon esculentum, Primer degenerate, Tehnik PCR.
Co-Authors , Agustiansyah , Rustikawati , Sukendah , Triadiati , Witjaksono ABDUL RACHMAD BUDIONO Ade Wachjar Adisyahputra Adisyahputra, Adisyahputra Agung Endro Nugroho Agus Purwito Agus Rachmat AHMAD RIDUAN Ahmad Surkati Ali Husni Amarillis, Shandra Amarullah, Muhamad Roffi Andrie Al Kausar Anita Yuliyanti Aniversari Apriana Anneke Pesik Anwar, Aswaldi Aprizal Zainal Arfan Nazhri Simamora Arief Hidayat Aris Munandar Asep Setiawan ASMONO, DWI Atmitri Sisharmini Bambang Heliyanto Bambang S. Purwoko BAMBANG SUGIRI Barahima Abbas C J Soegihardjo Cartealy, Imam Civi Cartealy, Imam Civi Catur Herison Cecep Kusmana Christoph Leuschner Clarry Sada Colleen M. Higgins, Colleen M. Darmawan Saptadi Deka Rotama Dewi Sukma Didiek Hadjar Goenadi Diky Anggoro DINARTY, DINY Dini Dinarty, Dini DINI NURDIANI Diny Dinarti Djoko Santoso DWI ANDREAS SANTOSA Dwi Asmono DWI HAPSORO Dwi Hapsoro Edi Guhardja Efendi, Darda Elina, Juanita ELSJE T. TENDA, ELSJE T. Endang Pudjihartati Endrizal Eneng Fakhrunnisa Enni Suwarsi Rahayu Erick Raynalta, Erick Fajar Laksono Suroso Fakhrunnisa, Eneng Fatsan, Ahmad FETRINA OKTAVIA Germini Alam Giyanto . Gusti Ayu Kade Sutariati H. M.H. Bintoro Djoefrie HAJRIAL ASWIDINNOOR Harsini ,, Harsini Hartati, Raden Roro Sri Haryadi Permana Hasriadi Mat Akin Hengky Novarianto Hengky Novarianto Hidayat Pawitan Hiroshi Ehara Hugo Volkaert, Hugo I MADE ARTIKA IBNUL QAYIM IDA HANARIDA SOMANTRI Iim Fatimah Ika Mariska Ikhsanudin Ikhsanudin Irman Firmansyah Ismail Maskromo Ismail Maskromo Iwa Sutardjo, Iwa Iwan Setiawan JAJAH KOSWARA Juang Gema Kartika Jumanto Jumanto Jumanto Jumanto, Jumanto Khoerul Anwar Khursatul Munibah Kukuh Murtilaksono Kukuh Setiawan Kurniasari, Praharisti Kurniawan R. Trijatmiko Kusumo Nugroho Kuswanhadi Kuswanhadi, Kuswanhadi Laksmita Prima Santi Laksono Trisnantoro Lila Yuwana Lollie Agustina P. Putri M. Herman Marbelisa Briliani Mardikaningsih, Agusti Marenda Ishak S MASKROMO, ISMAIL MEITY A. TULALO, MEITY A. Memen Surahman Meynarti Sari Dewi Ibrahim Muchammad Ali Safaat Muhammad Hasyim Bintoro MUHAMMAD HERMAN Muhammad Herman Muhammad Machmud Muhammad Machmud Mutia Dewi Yuniati Neviana Wahyuni Nihayati, Hanik Endang Niniet Indah Arvitrida Noor Cahaya NOVARIANTO, HENGKY Nur Khayati Nurhajati A. Mattjik Nursalam Nursalam Nurul Khumaida Paulus B.K. Santoso Purwaningsih Purwaningsih Purwoko, Devit purwoko, devit R B Gobel Ralf G. Dietzgen, Ralf G. Reni Indrayanti ROEDHY POERWANTO Rr Sri Hartati Rr Sri Hartati, Rr Sri Rr. Sri Hartati Rubiyo Rubiyo RULLY DYAH PURWATI RUSMILAH SUSENO S. Arsyad S. Ilyas Said Harran Saiful Akhyar Lubis SATRIYAS ILYAS Satriyas Ilyas Satya Nugroho Shinta Hadiyantina Sholeh Avivi Siswanto Siswanto Siti Mufidah Siti Sunarintyas SOEKISMAN TJITROSEMITO Sri H. Hidayat Sri H. Hidayat Sri H. Hidayat Sri Indarto Sri S. Harjadi Sri Soenarsih DAS Stephanie Wilamarta Sudari, Sudari Sudibyo Martono Sudirman Yahya SUDJINDRO SUDJINDRO Sugiyanta Sukendah S, Sukendah SUKENDAH SUKENDAH, SUKENDAH Sumali Wiryowidagdo Suryo Wiyono Susilo Indrawati Swastika, Maria Syafaruddin Syafaruddin TENDA, ELSJE T. Teuku Tajuddin TINCHE, nFn Tri J. Santoso Tri J. Santoso Tri Joko Santoso Tri Joko Santoso U.S WIRADISASTRA UJANG KHAIRUL Urai Salam Visia Assyafira Suwarto vyta andri setyo utami Wening Enggarini Widiatmaka . Widiatmaka Widiatmaka Widodo Widodo Wiwin Ambarwulan Yudiwanti Wahyu E. K. Yulis Setiya Dewi Yundari, Yundari Yuni Wibowo Yusnita Yusnita